其他杂项
IEEE 754 浮点特殊值
在 NumPy 中定义的特殊值可以通过:nan,inf,
NaNs 可以用作简陋的占位类型(如果你并不在乎初始的值是什么的话)
注意:不能使用相等来测试 NaN。例如:
>>> myarr = np.array([1., 0., np.nan, 3.])
>>> np.nonzero(myarr == np.nan)
(array([], dtype=int64),)
>>> np.nan == np.nan # is always False! Use special numpy functions instead.
False
>>> myarr[myarr == np.nan] = 0. # doesn't work
>>> myarr
array([ 1., 0., NaN, 3.])
>>> myarr[np.isnan(myarr)] = 0. # use this instead find
>>> myarr
array([ 1., 0., 0., 3.])
其他的相关的特殊值判断函数
isinf(): True if value is inf
isfinite(): True if not nan or inf
nan_to_num(): Map nan to 0, inf to max float, -inf to min float
除了从结果中排除nans之外,以下内容对应于常用函数:
nansum()
nanmax()
nanmin()
nanargmax()
nanargmin()
>>> x = np.arange(10.)
>>> x[3] = np.nan
>>> x.sum()
nan
>>> np.nansum(x)
42.0
NumPy 如何处理数字异常的
默认值为 Warn
表示无效、Divide
和溢出,Ignore
表示下溢。 但是这是可以更改的,并且可以针对不同种类的异常单独设置。不同的行为包括:
- 'ignore':发生异常时不采取任何措施。
- 'warn':打印 RuntimeWarning (通过Python
warnings
模块)。 - 'raise':引发 FloatingPointError 。
- 'call':调用使用 seterrcall 函数指定的函数。
- 'print':直接打印警告
stdout
。 - 'log':在 seterrcall 指定的Log对象中记录错误。
可以针对各种错误或特定错误设置这些行为:
- all:适用于所有数字异常
- 无效:生成NaN时
- 除以:除以零(对于整数!)
- 溢出:浮点溢出
- 下溢:浮点下溢
注意,整数除零由相同的机器处理。这些行为是基于每个线程设置的。
示例
>>> oldsettings = np.seterr(all='warn')
>>> np.zeros(5,dtype=np.float32)/0.
invalid value encountered in divide
>>> j = np.seterr(under='ignore')
>>> np.array([1.e-100])**10
>>> j = np.seterr(invalid='raise')
>>> np.sqrt(np.array([-1.]))
FloatingPointError: invalid value encountered in sqrt
>>> def errorhandler(errstr, errflag):
... print("saw stupid error!")
>>> np.seterrcall(errorhandler)
<function err_handler at 0x...>
>>> j = np.seterr(all='call')
>>> np.zeros(5, dtype=np.int32)/0
FloatingPointError: invalid value encountered in divide
saw stupid error!
>>> j = np.seterr(**oldsettings) # restore previous
... # error-handling settings
连接到 C 的方式
只针对下列选项进行阐述,阐述每一项工作原理的部分细节。
- 不借助任何工具, 手动打包你的C语言代码。
- 加分项(优点):
- 高效
- 不依赖于其他工具
- 减分项(缺点):
- 大量的学习开销:
- 需要学习Python C API的基础知识
- 需要学习numpy C API的基础知识
- 需要学习如何处理引用计数并喜欢它。
- 引用计数通常很难正确。
- 错误导致内存泄漏,更糟糕的是段错误。
- Python可能会改变API!
- 加分项(优点):
- Cython
- 加分项(优点):
- 避免学习C API
- 没有涉及引用计数
- 可以在伪python中编码并生成C代码
- 也可以与现有的C代码接口
- 应该保护你免受Python C api的更改
- 已经成为科学Python社区中事实上的标准
- 对数组的快速索引支持
- 减分项(缺点):
- 可以用非标准形式编写可能过时的代码
- 不如手动包装灵活
- 加分项(优点):
- ctypes
加分项(优点):
- Python标准库的一部分
- 适用于连接现有的可共享库,尤其是Windows DLL
- 避免API /引用计数问题
- 良好的numpy支持:数组在ctypes属性中包含所有这些:
a.ctypes.data a.ctypes.get_strides a.ctypes.data_as a.ctypes.shape a.ctypes.get_as_parameter a.ctypes.shape_as a.ctypes.get_data a.ctypes.strides a.ctypes.get_shape a.ctypes.strides_as
减分项(缺点):
- 不能用于编写代码转换为C扩展,只能用于包装工具。
- SWIG(自动包装发生器)
- 加分项(优点):
- 很长一段时间
- 多脚本语言支持
- C ++支持
- 适用于包装大型(许多功能)现有C库
- 减分项(缺点):
- 在Python和C代码之间生成大量代码
- 可能导致几乎无法优化的性能问题
- 接口文件很难写
- 不一定避免引用计数问题或需要知道API
- 加分项(优点):
- scipy.weave
- 加分项(优点):
- 可以将许多numpy表达式转换为C代码
- 动态编译和加载生成的C代码
- 可以在Python模块中嵌入纯C代码,并编织提取,生成接口和编译等。
- 减分项(缺点):
- 未来非常不确定:它是Scipy中唯一没有移植到Python 3的部分,并且有效地弃用了Cython。
- 加分项(优点):
- Psyco
- 加分项(优点):
- 通过类似jit的优化将纯python转换为高效的机器代码
- 当它优化得很好时非常快
- 减分项(缺点):
- 只在intel(windows?)上
- 对numpy没有多大作用?
- 加分项(优点):
Fortran 的接口:
包装 Fortran 代码的明确选择是 f2py。
Pyfort是一个较旧的选择,但不再支持。Fwrap是一个看起来很有希望但不再开发的新项目。
连接到 C++ 有以下几个方式:
- Cython
- CXX
- Boost.Python
- SWIG
- SIP(主要用于PyQT)